Zeneggen besitzt eine der wertvollsten naturnahen Kulturlandschaften der Schweiz. Das vielfältige Gelände von extensiv genutzten Magerwiesen und Äcker, Trockensteppen, Waldrändern und felsigen Zonen bietet zahlreichen bedrohten Tier- und Pflanzenarten Heimat: besonders erwähnenswert ist die Artenvielfalt bei Singvögeln, Schmetterlingen und alpinen Blumen.